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中国人自己的单细胞测序仪来了!

时间:2018-10-21 20:26   作者:admin 来源:未知 点击:
过去两年有一项大热的技术,大量研究人员通过这项技术解决重要科学问题,发表了大量高水平学术文章,这项技术便是单细胞测序技术。
 
单细胞测序技术,在这两年得到了蓬勃发展。一些高通量的单细胞测序平台开始为大家所熟知。有10×genomics单细胞测序平台、以及Fluidigm、WaferGen、Illumina/Bio-Rad等。
这些平台在很大程度上降低了单细胞测序的成本,使得单个细胞的测序成本变得极低。虽然单个细胞的成本降低了,但一个样本需要产生大量细胞的数据,所以单个样本的成本并没有很低。大多数的研究者会因这几十万甚至上百万的测序成本而对单细胞测序研究望而却步。有些希望从事单细胞研究或者希望提供单细胞测序服务的单位,也会因为测序平台高昂的价格而犹豫不决。
在这种形式下,上海净信潜心研发两年多,创新单细胞测序平台。该平台基于Drop-seq的技术原理,能够一次完成数千甚至上万细胞的单细胞测序。
大家所熟知的10×genomics单细胞胞测序平台依托的技术手段称之为inDrop-seq,论文在2015年发表与Cell杂志。该方法利用微液滴技术将带有条形码、索引分子、引物及其他的凝胶珠与单细胞混合。每个液滴内开展逆转录反应,以产生测序所用的带有条形码的cDNA。
 
10×genomics单细胞测序平台原理图
有意思的是,净信使用的Drop-seq技术与inDrop-seq技术发表与同一期的Cell杂志上。Drop-seq也是利用微流控技术将细胞分开,并与带有特定条形码的磁珠混合。磁珠上的Poly(dT)将细胞内的信使RNA捕获。收集磁珠净信逆转录和扩增,得到测序所用的带有条形码的cDNA。与inDrop-seq不同的是,Drop-seq的逆转录的过程是在液滴外进行的,这样逆转录的效率会更高。
 
净信单细胞测序仪原理图
净信的单细胞测序仪不管是从原理还是从测试结果看,能媲美仪器。它每个样本能够产生5000~10000个细胞,对上机样本的要求不再那么严苛。为防止实验失败造成的损失,机器还特别添加了能够监控实验过程的系统,一旦出现管道堵塞等情况,便可以及时止损。而关键的还是:该平台不论是从机器的购买成本,还是试剂耗材的成本都非常低。该平台的问世,再次将单细胞测序的价格拉低了一个台阶,使得更多的研究人员能够去利用这一先进的技术手段进行研究工作。
 
净信单细胞测序仪 样机图
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